研究生在使用知网查重系统时，常见问题是上传文档后无法查重或查重结果不准确。这可能是由于文档格式不符合要求、网络问题或系统故障所致。解决方法包括检查文档格式、网络连接，或尝试重新上传文档。另外，及时更新系统版本、清理缓存也有助于提高查重准确性。

另一个常见问题是查重结果显示高重复率，但实际内容并非抄袭。这可能是因为文献引用、公式、专有名词等内容被系统误认为抄袭。解决方法是在查重结果中标注这些内容属于正常引用或特定领域术语，并在论文中进行合理注释。此外，了解查重系统的匹配原理，避免误解系统结果也是重要的。